由于生活在水环境中，水生生物的疾病多发生在陆生动物生病时更容易发现，一般发现时鱼类部分死亡。给药方法也不像治疗陆生动物那么容易，病个体多数丧失食欲，口服给药只限于没有丧失食欲的组的养殖水体，给整个池塘浇水，只适用小面积的水体。大面积水池，使用量多，成本高，操作不便。而且，治疗药物多有毒性，有些药物还残留在池塘和动物体内，预防必须确立比治疗更为重要的观点。
病原生物引起的疾病是病原、宿主和环境条件三者相互影响的结果，疾病的预防可以从这三个方面着手
病原----控制和消灭病原体
1、使用无病原污染的水源
水及其水系统是水产养殖动物病原传入和扩散的首要途径。在建设养殖场之前，仔细考察水源，建设蓄水池，将养殖用水导入蓄水池自行净化，经过沉淀、消毒处理后再放入养殖池，可以防止病原从水源带入。
2、池塘彻底清淤消毒
池塘也是各种致病生物潜伏繁殖的场所，池塘环境是否清洁，直接影响养殖动物的生长和健康，因此池塘清泥是预防疾病和减少流行病爆发的重要环节。
3、强化疾病检疫
我们必须遵守《中华人民共和国动物防疫法》，做好养殖动物进出口检疫工作。
4、建立隔离制度
养殖动物发病后，任何疫病都应首先采取隔离措施，防止疫病传染、蔓延到邻近地区。
5、实施消毒措施
主要消毒苗种、养殖工具、饲料和饲料场。
宿主----增强养殖群体抗病力
1、培育和放养健壮苗种
放养的种苗体色正常，健康，必要时用显微镜检查，确保鱼苗无严重危害病原。
2、免疫接种
免疫接种是控制水产养殖动物爆发性流行病的有效方法，近年来预防鱼类重要流行病的疫苗不断应用。
3、选育抗病力强的种苗
方法之一是从病池中选取未感染或未感染但很快痊愈的个体，培养成繁殖用亲体。
4、降低应激反应
应激源过强，养殖动物能量消耗过大，降低生物抵抗力。因此，养殖过程中应创造条件减少压力。
5、加强日常管理，慎重操作
6、饲料应质优，量适
环境----改善和优化养殖环境
1、合理放养
包括两个方面，一是密度合理，二是混养不同种类的组合合理。
2、科学用水和管水
通过监测水质各参数，了解其动态变化，及时调节，纠正不利于水生动物生长和健康的诸多因素。主要水质参数有pH、溶解氧、盐分、温度、氨氮、硫化氢、透明度等。
3、适时适量使用水环境改良剂
它能改善和优化水生环境，具有促进养殖动物正常生长和发展的一些物质。常用石灰、沸石、过氧化钙、光合细菌。
